Etwas mehr Info wäre von vorteil.
Wie sieht die Struktur der Tabellen aus? Welche Felder sollen berechnet werden?
Was ist der Primärschlüssel anhand dessen die ensprechenden Datensätze der beiden Tabellen zugeordnet werden können? Wie soll dir Struktur von Tabelle C aussehen?
Mit den Info könnte man dann was zusammenstückeln.
Grundsätzlich würde ich allerdings so vorgehen:
Die entsprechenden Werte abfragen und in ein Recordset nehmen
Dann in einer Loop die Werte subtrahieren und in die TabelleC schrieben
Beispiel:
$sql = "Select tabA.Wert as Wert1, tabB.Wert as Wert2, tabA.ID as ID from tabA left join tabB on tabA.id = tabB.id;"
$result = mysql_query($sql);
while($rs = mysql_fetch_array($result,MYSQL_ASSOC))
{
$ergebnis = $rs['Wert1'] - $rs['Wert2'];
$sql2 = "insert into TabC (ID, Ergebnis) values ($rs['ID'],$ergebnis);
$result2 = mysql_query($sql);
}
Keine Garantie auf syntaktische Richtigkeit
Aber so auf die Art wäre mein ansatz.