wie immer kann man da keine pauschale DAS ist die EINZIG RICHTIGE Methode Antwort geben...
beim "händischen" Kopieren ist die Chance groß, dass versteckte, System, geöffnete usw. Dateien nicht kopiert werden oder der Stand von Datei A nicht mir der von B übereinstimmt, weil eine ganz am Anfang der mehrstündigen Kopierorgie und die andere am Ende kopiert wurden.
solche Dinge umgeht man mit einem "Klone" Tool. Wobei man sich auch da noch wieder überlegen muss, ob man die ganze HDD "raw" oder nur eine Partition "kopieren" möchte. Letzteres ist natürlich "gefährlich", wenn man nicht weiß was man tut. Wenn die HDD aber schon ein "Vorleben" hatte, muss man ja nicht irgendwelchen Müll mit schleppen (alter Boot Partition oder was auch immer), was schon lange nicht mehr benötigt wird.
nochmal komplizierter wird es, wenn da (System/Hintergrund) Programme im Spiel sind, die Datenbanken geöffnet haben.
am Ende ist es ja aber so: man legt eine Kopie an. Wenn man sich nicht ganz dusselig anstellt, dann hat man ja das Original, steckt es ab und guckt dann, ob mit der Kopie alles i.O. ist. Gibt es da Zweifel, macht man es nochmal richtig.