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Am besten formatieren (Schnellformatierung reicht), falls auf der HDD nichts mehr drauf ist, was du brauchst. Beim installieren von Win 10 nur die SSD am System lassen. Bei der anderen Kabel abziehen.
Kannst du hinterher wieder anstecken und vom neu installierten Win 10 formatieren, bzw. ggf. vorher noch Daten sichern wenn sie wichtig sind, wie Bilder, Videos usw.
Oder es einfach sein lassen. Who cares So kannste zur Not einfach die Bootreihenfolge ändern und wieder von der HDD booten. Wenn es wirklich weg soll, dann am Besten gleich alles formatieren. Dann sind auch die versteckten (Benutzer) und sonstigen Windows Ordner (Programme) weg.