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An sich ja nicht, auch wenn der erste Slot im Handbuch "empfohlen" wird. Sind beides PCIe 3.0/2.0 x 16 Slots.
Würden nur als x8 laufen, wenn beide Slots belegt sind(Dual).
Vielleicht nützt's was, wenn du den Slot manuell unter PCH auf GEN2 stellst. Glaub aber irgendwie nicht, sollte das Board ja automatisch machen.
Jedenfalls brauchst du dich nicht wundern, so lange in GPU-Z @x8 statt @x16 steht.