iOS ist halt ein sehr konsequent geschlossenes System.
Genauso, wie man nicht einfach so seine eigenen Apps installieren kann (also im normalen, nicht root-Fall versteht sich) und immer über den App Store muss, können auch Dateien nicht ohne Kontext auf das Gerät kopiert werden. Das Gerät lässt sich zwar als Festplatte verwenden, aber die Dateien sind dann nicht von iOS ansteuerbar.
D.h. eine Datei muss irgendeiner App gültig in iOS zugeordnet werden können, sprich die App kann dann auch was damit anfangen. Daher immer der Weg über die Medienbibliotheken für Musik etc. oder eben bei VLC der Umweg über den eigenen Storage für die App, der dann von allen anderen Apps separiert ist.
Dateien müssen also auf eine "gültige" Art und Weise dem System oder einzelnen Apps bekanntgemacht werden. Entweder sorgt iOS dafür selber, da es für alle Dateien, die über iOS direkt ins System gelangen (z.B. Downloads), den Weg festlegt, oder über iTunes, welches Medien entsprechend vorbereitet, damit sie verwendbar sind, oder Dateien fest Apps zuordnen kann, unabhängig vom Rest des Systems.
Daher gibt's keinen Dateiexplorer im klassischen Sinn, wie beim PC oder Android. Das kann gar nicht gehen ohne root-Rechte.