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Meinst du die Icons der Programme? Die sind natürlich fest in jedem Programm enthalten und könnten nur geändert werden, wenn du die Icons der Programme selbst änderst - was aber nicht so einfach oder auch gar nicht möglich ist.
Mit Microangelo kann man bspw. die Icondateien öffnen - aber man muss die Farben halt selbst abändern.