Zuerst: Es sind sicher nicht die selben Einstellungen. Das geht schon gar nicht, weil Nvidia und AMD nicht die selben Treiber verwenden. Dann haben die Karten auch unterschiedliche Architekturen, Features, etc.
Und letztendlich sind Spiele auch optimiert, der Treiber bringt Einstellungen mit.
Ich vermute eher, dass in der "Lobby" ein nicht einsehbares und änderbares Framelimit läuft und das ist eben unterschiedlich, warum auch immer.
Viel wichtiger wäre, ob die Ingame-Performance durch eine bessere Karte auch schlechter geworden ist.
Dann könnte man noch die Limits prüfen, z. B. über GPU-Z oder HWInfo.
Ich vermute, dass der TE durch Unwissenheit denkt, die Karte sei langsamer, nur weil ein Spiel weniger FPS in einem Bereich anzeigt, der nicht relevant ist. In Menus haben Spiele fast immer FSP-Caps hart eingestellt, ich würde niemals auf die Idee kommen, das als "Benchmark"-Wert heranzuziehen.