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Tja. Einfach probieren. Ausschließen kann man unter Windows nichts.
Ich habe mit PartitionsMagic 8.0 schon mehrfach die Partitionsgrößen geändert, ohne anschließend Probleme mit dem System zu haben.
Ich weiß nicht und bezweifele auch ob eine erstmalige Neupartitionierung Windows ohne Fehler übersteht.