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Das muss man vorher bedenken, denn Linux kann auch keine proprietäre Verschlüsselung der mitgelieferten Programme lesen.
Ein Port von Linux wäre prinzipiell möglich, ist ja OSS.
Nebenbei kann man auch ein Linux von CD booten und eine fat-Partition mounten. Neben NTFS sollten Dual-Booter immer 1 - 2GB für fat abstellen, um Dateien reibungslos zu transferieren.