X3 Reunion kannst du gleich auslassen, X3 Terran Conflict ist im Grunde das gleiche Spiel, nur das diverse Community Mods direkt mit integriert worden sind und das Spiel damit von Grund auf deutlich besser ist. X3 Albion Prelude verändert einiges daran wie das Spiel läuft, ist aber im Grunde natürlich immer noch X3. Ich persönlich bevorzuge X3TC, mit einigen Mods dazu (ein paar Handelsverbesserungen, zusätzliche kaufbare Stationen, etc.), gegenüber X3AP. Wichtig für dich ist eigentlich nur dass X3TC und X3AP zwei verschiedene Spiele sind, auch storymäßig. Wenn dir diese also wichtig ist solltest du sie nacheinander spielen. Wenn dir die Story wurscht ist und du dich nur für's freie Spiel interessierst ist es Geschmackssache, was man bevorzugt.
X4 brennt mir seit Ewigkeiten Löcher ins Library, habe es aber bisher nicht gespielt, von daher kann ich dazu nichts sagen.