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m.E. sind bei dem Board die SATA Anschlüsse nicht shared, Verlierst du also nicht.
Edit:
Achso, der zweite M2 Port ist nur PCIe 3.0, der erste kann 4.0 wenn du nen Ryzen 3000 oder 5000 hast.
Edit2:
Wer lesen kann... Hast ja geschriben, du setzt ja eh nur 3.0 ein.
Habe ich bei mir auch so im Einsatz.
Ne 6900XT mit PCIe4 und 2x NVME mit PCIe3. Und 2x SATA.
Zumindets bei mir im BIOS werden die anderen SATA-Ports nicht als inaktiv angezeigt.