Der Client spuckt auch reine Zertifikate aus auf Wunsch. Denn nicht für jede Software steht schon ein Plugin zur Verfügung was die Konfiguration passend abändern kann.
If you want to use a webserver that doesn't have full plugin support yet, you can still use "standalone" or "webroot" plugins to obtain a certificate:
./letsencrypt-auto certonly --standalone --email admin >thing.com> -d <thing.com> -d <www.thing.com> -d otherthing.net