Um hier jetzt mal kategorisch zu widersprechen, es ist nicht egal, in welcher Reihenfolge die Komponenten im Kreislauf sind, und wer etwas anderes behauptet, hat entweder nicht aufgepasst oder bewusst ein Setup gewählt, wo es nicht so sehr auffällt.
Generell wird das Wasser in den Kühlblöcken erwärmt und in den Radiatoren abgekühlt, man hat also grundsätzlich eine Temperaturdifferenz im Kreislauf. Wie hoch diese ausfällt, wird von 2 (3) Faktoren bestimmt.
1. Die Wärmeleistung. Umso mehr Abwärme die Hardware erzeugt, umso stärker wird das Wasser beim Durchlauf erwärmt und in den Radiatoren auch wieder abgekühlt.
2. Der Durchfluss. Umso höher der ist, auf umso mehr Wasser verteilt sich die Wärme und damit fallen die Unterschiede geringer aus. Bei niedrigem Durchfluss umgekehrt, die Unterschiede sind höher.
(3. Die Wärmekapazität des Kühlmittels. Da wir entweder Wasser oder größtenteils aus Wasser bestehende Kühlmittel verwenden, ist die Wärmekapazität in einem bestimmten Bereich, sodass man da eher wenig sehen würde.)
Wenn man also einen hohen Durchfluss und wenig Verbrauch hat, dann ist die Position der Komponenten im Kreislauf nahezu egal, weil die Temperaturunterschiede im Kreislauf niedrig ausfallen. Wenn man aber mit eher wenig Durchfluss und viel Verbrauch arbeitet, dann fallen die Temperaturunterschiede deutlich aus.
Ein Beispiel: Moderne Hardware kann ordentlich Strom fressen und so sind 500W Abwärme nicht ungewöhnlich. Geht man nun von den so oft empfohlenen 60l/h Durchfluss aus, beträgt der Unterschied zwischen wärmster und kältester Stelle im Kreislauf grob 7,5°C und das wird auch jeder nachmessen können, der Temperatursensoren an den entsprechenden Stellen hat und sein System auf den Durchfluss und den Verbrauch einstellt.
Natürlich kann man auch entsprechende Einstellungen treffen, um bewusst nichts zu merken. Wer im Idle mit dem Durchfluss spielt, kommt immer zu dem Schluss, dAss mEHr duRchFluss Ja gaR NiX briNgt und dIE ReiHenfOlge jA VöLLig eGal iSt. Als ob man keine Experimente so fälschen könnte, dass sie das gewünschte Ergebnis bringen, sei es absichtlich oder aus Unwissen.
Schaut man sich jetzt moderne Hardware, deren übliche Temperatur und Leistungsaufnahme an, so hat man eine CPU, die zwar nicht so viel verbraucht, aber aus bestimmten Gründen doch sehr warm wird und so ein erhöhtes Risiko hat, die Leistung zu drosseln, und eine GPU, die säuft wie ein Loch, aber (unter Wasser) trotzdem nicht allzu heiß wird. Die Schlussfolgerung ist einfach, zuerst kommt die CPU, dann die GPU. Warum? Die CPU braucht kühleres Wasser, um etwas mehr Abstand vom Temperaturlimit zu haben und erwärmt das Wasser weniger stark als die GPU. Somit ist die GPU in dem Aufbau nur minimal wärmer, während umgekehrt die CPU deutlich wärmer wäre.
Das ist der thermische Teil.
Funktional ist es zudem praktischer, von Pumpe und Agb aus zuerst CPU und GPU abzubacken und dann in den Radiator zu gehen, weil man so die Kühlblöcke, bei denen es vergleichsweise wichtig und teilweise schwierig ist, möglichst leicht zu entlüften, während es beim Radiator nicht so schlimm ist, wenn da noch bisschen Luft drin ist. Der Radiator braucht auch länger zum Entlüften, sodass man bei einem umgekehrten Aufbau deutlich länger Luftblasen in die Blöcke gespült bekommt, ehe die ganze Luft raus ist.
Zudem sollten Filter grundsätzlich immer möglichst direkt vor den Kühlern verbaut werden.