Geh mal ein bißchen weniger exzessiv mit den Forenfeatures um. Das artet ja in Arbeit aus, deinen Beitrag vollständig zu lesen
Also generell: Dass ein Spiel läuft und ein anderes, völlig unterschiedliches nicht, hat nichtmal unter Windows für sich genommen eine Aussagekraft, daher ist der Vergleich mit Factorio nicht sinnvoll, weil daraus keinerlei Erkenntnis zu gewinnen ist.
Was auch nicht unbedingt eine gute Idee ist, ist es Spiele auf der Windows Partition zu belassen und unter Linux zu starten, da die Dateisysteme sehr unterschiedlich sind. Das kann ganz unterschiedliche Folgen haben die man auch unterschiedlich angehen kann, wenn man das dennoch durchziehen will. Aber es funktioniert nicht jedes Spiel in jeden Fall ootb, wie du ja merkst, man muss also etwas basteln. Du kannst ja z.B. das hier mal versuchen. Ich habe es selbst aber nicht probiert:
https://steamcommunity.com/app/221410/discussions/8/2942496178835967098/
Es soll aber auch andere Methoden geben.
Hier noch ein Beitrag von Valve selbst dazu:
https://github.com/ValveSoftware/Proton/wiki/Using-a-NTFS-disk-with-Linux-and-Windows
Einfacher ist es jedoch, das separat zu halten. Erspart Probleme.
Ansonsten wäre ein Blick auf Logs, wie es
@Tevur vorschlägt, sicherlich auch nicht verkehrt.
